巴氏杀菌机原理在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的zui适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。

    但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢， 在食品、饮料、制药等行业中，要求对一些包装完毕的产品进行水浴灭菌。被包装好的产品放在可调速的不锈钢网带上，在传送带的作用下按序进入灭菌箱体内，经由"高温水为介质"杀菌后。

    再由传送带带人冷却箱体内均匀冷却，从而达到产品杀菌要求。该系列设备连续运转，已灭菌的包装产品被源源 不断送入下一生产工序。巴氏杀菌机的原理是巴氏消毒法，它是由法国微生物学家巴斯德发明的冷杀菌法，是一种利用较低的温度既可杀死病菌又能保持物品中营养物质风味不变的消毒法。

    一般微生物生长的适宜温度为28℃-37℃，温度太高，细菌就会死亡。巴氏杀菌机就是一种是将牛奶等食品加热到60~65℃，保持30分钟杀菌，然后将温度急速冷却到4-5℃进行保存。这种杀菌，多用于牛奶等，既能将病原菌杀死，也可减少营养损失。但这种消毒方法，不能杀死所有细菌和微生物，因此保质时间很短。